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本帖最后由 zhousht 于 2020-7-4 20:09 编辑
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1 b, N- T7 X% N. p. `COVID-19的来源:卡尔加里大学的研究表明,SARS-CoV-2自2013年以来缓慢发展. |" e6 O. Y) U V* i$ r8 L
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加拿大卡尔加里大学的科学家表示,至少从2013年以来,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)可能已在人类中传播,尽管与造成现在大流行的病毒变种不同。: e2 s( V- W* }
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尽管科学家们一直在研究病毒基因组以寻找更多信息,但有人建议该病毒从一种动物跃入人类。尽管研究指出它的起源是自然的而不是人为的,但也有一些关于在实验室中制造它的理论。上个月,WHO通过了一项决议,调查该病毒的起源。4 M5 Q% Q: z. P8 n, c# ^
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现在,加拿大卡尔加里大学的一组科学家说,造成COVID-19的病毒(SARS-CoV-2)至少从2013年开始就已经在人群中传播,尽管与引起这种情况的变种与当前的大流行变种不同。) D2 Q* @ K/ d4 |" ]4 m
( N7 `$ A. ]% R# H8 K该研究的结果目前可在预印本服务器Biorxiv中使用,并且该研究尚未经过同行评审。8 [9 x: R0 N- q; E' \
' Y' e: x7 m" h' T7 k$ \本文还探讨了SARS-CoV-2的可能起源以及ACE-2受体在病毒的感染性(感染能力)中起着多大作用。# Q+ @4 a, o6 V# a/ N* P
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病毒进化的过程% ~1 T7 h) m+ z5 }! z7 E" a* T: S
' `. ~9 U" ], }为了能够生存,病毒会随着其宿主生物不断发展。当病毒跳跃宿主时,通常会出现一种新的病毒病原体,例如从动物到人类。因此,即使该病毒在原始动物宿主中引起轻度疾病或没有引起疾病,它在人类中也可能是高度传染性/高毒性的。就冠状病毒而言,已经发现病毒生活在蝙蝠内部而不会对蝙蝠造成太大损害,因为蝙蝠的免疫系统已经进化,可以控制病毒。但是人类却并非如此。结果,人类感染病毒容易生病。
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研究发现
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该研究检查了SARS-CoV-2刺突蛋白的当前变体,以及它与人类ACE-2受体(hACE-2)结合的强度。新冠病毒的突突蛋白与人体细胞上的ACE-2受体之间的结合是帮助病毒进入健康细胞的原因。# w, w( a5 ^( ]. M( x( d; G f6 n
4 o0 }2 ~5 L6 G+ C2 ?9 n在这项研究中,卡尔加里大学的研究人员调查了2019年12月30日至2020年3月20日之间收集的约479种新型冠状病毒基因组序列,以了解其系统发育-这意味着该病毒的进化发展 ,以及与其他关系密切病毒的关系。
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在所有基因组中,研究人员发现感染率超过5%的病毒约有16种变异和大约11种错义突变(其中一个核苷酸的变化使DNA / RNA编码不同的蛋白质),每种感染都有自己的系统发育树。8 D5 l; ^3 ~ g" Z. M
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他们的另一项初步发现是与蝙蝠和穿山甲冠状病毒的相似性。已发现SARS-CoV-2的基因组与蝙蝠冠状病毒RaTG13至少有96%的相似性,与穿山甲冠状病毒(Pangolin-CoV)至少有90%的相似性。以前曾有人提出,当前的病毒是这两种病毒的组合,是由于宿主中的共同感染而产生的。
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为了研究起源,研究人员试图创建SARS-CoV-2突突蛋白受体结合域的遗传序列。受体结合结构域是刺突蛋白中实际上识别并与ACE-2受体结合的部分。他们为所有SARS-COV-2病毒创建了一个共同的遗传RBD序列,并将其标记为N1,并用最接近的动物病毒的变种标记为N0(N-零)。
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2 L2 M+ H! {6 p6 B# Y. i他们的发现:
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N1序列与SARS-CoV-2病毒的参考序列相同,正如所预期的那样,而N0序列是唯一的,指向病毒的独特来源。+ d( W8 u+ ^5 A; C) g0 H
两个RNA / DNA序列仅在四个位置不同。3 ?4 o' {) h$ P) ?8 [
祖先的序列产生了各种后代,而RaTG13是SARS-COV-2病毒的近亲之一。由于RaTG13是在2013年左右发现的,因此引起病毒的COVID-19的原始祖先一定也在那时。
5 j2 X' |: v3 } E1 q) q l有趣的是,该病毒的早期变体与hACE2的结合远比最近的变体强。# f P, {9 F$ b1 P
+ o. g& R- u- h- H结论:% B R1 \+ ?3 b5 Q! w
d1 `' f, k T3 O研究表明,SARS-CoV-2的结合亲和力可能不是其传染性的决定因素。肯定还有其他变化导致病毒对人类的感染性增加。同样,该病毒的祖先可能已经感染了人类一段时间,但症状较少。" O+ M3 b2 v5 W
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